Περιλαμβάνει την αφαίρεση του πολφικού ιστού (των νεύρων) από τις ρίζες των δοντιών και την έμφραξη των ριζικών σωλήνων με ειδικά υλικά. Εάν η θεραπεία γίνει σωστά τότε εξασφαλίζει την υγεία του δοντιού για πολλά χρόνια ακόμα. Υπάρχει περίπτωση όμως να χρειαστεί και επανάληψη της ενδοδοντικής θεραπείας σε περίπτωση που η θεραπεία δεν είναι επαρκής και συνεχίζονται να αναπτύσσονται μικρόβια και υφίστανται αλλοιώσεις στους περιακρορριζικούς ιστούς.